アフィリエイト収入は事業所得でもあり、雑所得でもあります。
そのケースによりけりです。

事業所得として申告するためには、『個人事業の開廃業等届出書』を税務署へ提出し、承認されている必要があります。『個人事業の開廃業等届出書』は開業から1ヶ月以内に提出します。事業として認められれば、毎年申告することになります。赤字や納税金額が0円の場合でも申告することになります。
雑所得のほうが簡単でいいように見えますが、個人事業と青色申告が認められれば、雑所得にはない大きな節税効果が得られます。

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